1.自身免疫，慢性非細菌性前列腺炎患者的血液、精液和前列腺組織的免疫學研究中，發現血清和精液中白細胞介素、補體和免疫球蛋白的濃度均升高，而且在前列腺活檢組織中發現腺泡內T淋巴細胞浸潤和相關炎癥反應。

　　2.基因致病　 有調查指出：NOD2基因與慢性非細菌性前列腺炎的發病可能有關聯。雖然這方面的研究尚較少，但根據基因在許多疾病中的重要作用推斷，慢性前列腺炎的發病也應與基因密切相關。但仍然需要進一步作家族調查，更大的試驗人群和其他的對照人群的研究才能確定。

　　3.神經生長因子、氧化應激和鋅的作用　 研究發現神經生長因子與慢性非細菌性前列腺炎的疼痛嚴重程度和IL-10水平直接相關，證實神經生長因子在慢性非細菌性前列腺炎的發病中起一定的作用。

　　4.微生物感染　 由沙眼衣原體、解脲支原體、厭氧菌和病毒等微生物是引起慢性非細菌性前列腺炎的重要原因。